NVEs miljøtilsyn skal kontrollere at bygging, vedlikehold og drift av vassdrags- og energianlegg skjer i henhold til krav fastsatt i eller i medhold av vassdrags- og energilovgivningen.
Seksjonens oppgaver omfatter godkjenning av planer for anleggsgjennomføring slik at landskap og miljø blir ivaretatt på best mulig måte, og kontroll i bygge- og driftsfasen. Omfanget vil variere avhengig av tiltakets art og størrelse.
For vassdragsanlegg er pålegg og kontroll av hydrologiske undersøkelser og oppfølging av konsesjonsvilkår som minstevannføring og manøvrering av reguleringsmagasin sentrale områder.